Делаешь файл на флешке (в корне), обзываешь autorun.inf
вот его содержимое:
[autorun]
OPEN=AUTORUN.EXE - у тебя твой_файл.bat
ICON=AUTORUN.EXE - тут откуда иконку брать

Вместо AUTORUN.EXE должен быть твой батник вот и всё...