Комменты:
После считывания файла все его строки сортирую, при этом одинаковые окажутся рядом. На это совпадение и проверяю. При желании можно прикрутить strtoupper/strtolower дабы не обращать внимания на регистр.

2ZaCo Напиши эффективнее, ты ж чингачкук.