Дело в том, что когда не обновляешься длительное время, а потом решил обновиться, то скачивается большой объём пакетов в сжатом виде - это раз. Потом для распаковки этих пакетов нужно ещё больше места - это два. Так что с 16гб флешкой, я больше чем уверен будут возникать проблемы.