Попробовал накодить скрипт. Кидаете исходный список (который надо сортировать) в start.txt , файл должен быть в том же каталоге, что и php скрипт. И запускаете пхп.

Также в php есть функции array_unique (удаление повторяющихся значений в массиве) и asort (должен сортировать по алфавиту строки).