Вы когда нибудь сталкивались что в ветку stable уходили дистрибутивы программ которые ну никак не хотят нормально работать?
Пример - пожалуйста, почтовик - postfix - собирал руками дыба наложить патчи. Потом dspam - пришлось откатываться на предыдущую версию чтобы он работал так как надо.
Pidgin, пересборка ядра, проблемы локализации, не говоря уже о том что некоторого софта в репозиториях amd64 нету.
И напоследок - *-based дистрибутив - это не только набор софта из репозитория, это еще какие то фишечки типа готового набора для работы c windows mobile, тач скрином или сканером отпечатков пальцев...
P.S Смотря что считать "сторонний репозиторий", backports.org вроде и не debian'a а вроде и ппц сколько всего там лежит.