Сдается мне, что это симптомы винды, т.к. весь софт в маке удаляется корректно. На будущее в юниксе зависимость файлов реализовано не так как в виндовс, поэтому при установке/удалении программ влияние "мусора" никоим образом не влияет на производительность.