Для опытного и знающего человека, советую именно FreeBSD(у самого стоит и я счастлив, далеко не первый год)
Для среднего админа, средней руки, советую CentOS или Debian
ну и для новичков Ubuntu Server.
Можно конечно взять и какой-нить релиз, какой-нить ASPLinux, ALTLinix и подобных, но нафига извращаться?!
Вообще, лучше почитать хендбук и поставить именно FreeBSD. Останетесь довольны.