Во-первых надо писать без ""
echo 127.0.0.1 localhost >> %windir%\system32\drivers\etc\hosts
так то есть, иначе с кавычками запишется в хостс
Во-вторых - какая винда? Если виста или 7-ка, то запускайте от имени админа и вырубите не помню как называется, в общем ограничение на выполнение приложений, политика какая-то, по умолчанию в 7-ке врублено.
В-третьих - это для всех окон, смотрите антивирусы и системы защиты свои, может они блокируют...

ЗЫ: Батник делает всё как надо, на 7-ке только что проверил.