Немного перефразирую, чтобы было понятнее - /var/www/html/ - полный путь до конкретно интересующего тебя файла, про который ты спросил а именно index.html

А так, да, корень сайта находится по /var/www/.

Как понял? Ну, очевидно же, что если index.html не лежит в /var/www/, то единственным местом, где он может находится будет /var/www/html/