убунту - это настроенный для десктопа дебиан, скажем так.
Ну и политика насчет софта разная у них.

Делать так:
vim /etc/apt/sources.list
далее туда вписываем источники пакетов для нужного дистрибутива(дебиана или *убунты)
После этого:
sudo apt-get update
sudo apt-get dist-upgrade

Усе =)