Может статика, может питание с USB-хоста материнка сняла раньше завершения всех операций с флешкой, может антивирус решил пошуршать по флешке (касперыч особенно это любит) перед завершением работы - вариантов могут быть сотни. Насчет статики, кстати, вспомнился момент, когда я, не снимая куртку, сел за комп. Сижу, работаю, и тут через джинсы щелкнула статика на сиденье. Несмотря на то, что от ноги до стола было около полуметра, клавиатура жалобно моргнула лампочками и сдохла.