Под систему однозначно SSD.
Минусов нет (забудьте про количество циклов записей/перезаписей, давно уже не актуально и т.д.), кроме того, что в ноутбуке будет потреблять постоянно одинаково, в отличии от HDD, который в состоянии простоя потребляет меньше SSD.