В отличие от SSD, когда файлы перераспределяются при перезаписи по свободному пространству, на флэшки все пишется тупо. Но, все равно количество циклов перезаписи для современных флэшек исчисляется примерно N*10000, где N зависит от производителя и модели. Поэтому, скажем, при активной работе и порядка 10 перезаписей файла в день для самой стремной флэшки минимальный срок срок ограничивается 3 годами.
Имхо, бояться не нужно)