1) пользуюсь чекером из программы AccessDiver, меня вполне устраивает.
2) можно, вопрос только в их скорости
3) кол-во потоков зависит напрямую от соединения. 100-200 вполне достаточно.
тайаут: если прокси для брута, то вообще больше 3000 ставить не рекомендуется, но лучше ставить ~10000, ибо у паблик прокси крайне непостоянное время отклика.
4) проводится сканирование тех портов, которые ты указал в настройках чекера.