Да, какой-то полтергейст получается.
А если попробовать в момент, когда диск тормозит в менеджере задач посмотреть какой процесс в этот момент винт грузит.
Может это как-то прольет свет?

Кстати, еще, десятку ставили с микрософтовского дистрибутива?
Не с образа какого-нибудь левого?
Ставили в штатной конфигурации? Тюнингом не занимались, типа "запретов на шпионство" и подобное?
Активировали как?