Собрать недорогую рабочую станцию на базе i3, i5. Главное подобрать материнку с поддержкой raid массивов и максимальным кол-вом sata разъемов. В win2012 server готовый профиль для файлового сервера. Это, по моему, самый простой вариант для недорогого домашнего файлового сервера.

P.S. Ну и раз у вас много различных hdd, то минимизировать все провисания по lan. Для этого хороший гигабитный свитч