По сути не обязательно делать бекап всей системы. На новой машине ставите с ноля Asterisk а со старой просто перенесите с автозаменой два конфиг файла в которых хранятся все учетки (уточните в гугле как это делается)
extensions.conf
sip.conf
Я у себя на работе так обновлял и все работает.