Кароче не сколько я понимаю простоая читалка файлов средствами java.
Надо докапаться до послного пути (в etc/passwd)

Наверное там есть что нибудь типа админки. Я структуру томката плоховато знаю. Сайт хороший надо его добить общими силами

Там еще кстати апач обычный есть