Сам когда первый раз федору ставил немного удивился. На самом деле нужно просто тыкнуть "далее" и там уже будет видна логическая структура. Короче вот пошаговая ин-ия:
После экрана "обновление\новая установка" нужно будет выбрать "создать разбиение вручную" тыцнуть "далее" дальше выбрать там твой 6-гиговый раздел, удалить его, а на пустом месте создать 2 раздела, 1-ый swap (~500м (зависит от кол-ва оперативы)), 2-ой ext3 на все оставшееся место, ну и указать ему точку монтирования "/"

з.ы. сори не читанул 2-ую страничку