Kali Linux все так же продолжает работу, как и до этого BackTrack.

Вот в этой книге не плохо все описано

http://it-ebooks.info/book/3000/

Много где используется website clone tool, как я понимаю - это безопасный способ проверить любой сайт на уязвимости на базе его копии.