Это баг 2 версии карты. Первая версия карты сломалась вовсе, когда кол-во точек на карте превысило 1000. Сейчас работаю над 3-ей версией, но там свои сложности. Подробнее на гитхабе https://github.com/binarymaster/3WiFi/issues/1

Кстати, нагрузка на сайт возросла и временами сайт может быть не доступен - не пугайтесь, обновите страницу позже. Если файл не загрузился на сайт или операция была прервана, повторите загрузку файла в базу позже. Данные не дублируются, так что повторная загрузка не приведет к появлению дублей. И по возможности не грузите файлы больше 1Мб, тем более одновременно в нескольких вкладках - хостинг ограничен и по процессорному времени и по оперативке.