OSX=Coda

Win=Notepad++ - но о нем выше сказано уже

в cpanel насколько знаю есть свой редактор

но я бы советовал десктопным редактором просто синхронизировать с хостом и спокойно редактировать, избавишь себя от некорректных кодировок при сохранении как минимум.

при траблах с синхронизацией дергай скрипт с хоста и открывай в редакторе, при сохранении автоматом обновится на хосте.

бекапить перед редактированием не забыть главное.