1) шифрование процедур + расшифровка только после ввода ключа. "-" при наличии ключа защиты нету)
2) прога докачивает часть функционала по инету (куски процеду) "-" наличие инета
3) навесить супер-мега крутой прот (темида, ехекрутпор т.д.) "-" размер и скорость
4) обернуть важные процедуры в ВМ "-" скорость
5) нафтыкать кучу (несколько десятков) различных проверок на модификацию файла и т.д. "-" замучаешься отлаживать сам)

у каждого метода свои + и -

всё остальное баян и легко обходиться...