Атомы обычно для передачи сведений между приложениями используют, или состояний, как семафоры но ток для всех процессов винды.

И можно неплохо так поднасрать системе если использовать всю структуру в целом, например при копировании и вставке, через атом подделать формат не соответствующий содержимому и вызвать у принимающего приложения переполнение буфера из-за отсутствия необходимых проверок соответствия.