это такой файлик, написанный на пхп, допустим.
Через этот файлик ты можешь просматривать фтп сайта, его структуру, файлы, выполнять удаленно команды и т.д.
Самый известный шелл - remview.php
Заливаешь его кому-нить на сайт и о радость! Ты можешь смотреть что за файлы скрываются на сайте и их исходники можешь просматирвать! Ну разве не чудо?!) А ещё можешь с помощью шелла заливать свои файлы на сайт.. но только в ту папку, куда это разрешено делать.
Вкратце так.. если чё пропустил - дополните))