Вспоминай) Вообще-то на сервере файлы лежат в изначальном виде (формате), это когда они вызываются по-другому (к примеру через mod_rewrite в .htaccess), их сервер открывает. Так что если это банальный шелл, то он всегда будет на сервере лежать как .php файл.