Как пишут в документации (WineFAQ), Wine - это не эмулятор (Wine Is Not a (CPU) Emulator - WINE), он только предоставляет структуру Windows API при соответствующих запросах от выполняющейся программы. Как объясняется здесь же, благодаря этому Wine может выполнять видовые приложения на полной скорости. Правда, мне кажется, что создатели Wine немножко не правы, так как в любом случае программа создает своеобразную подмену программного интерфейса - если вместо Linux API предоставляется структура, подобная WinAPI, это значит, что она эмулируется.