Вот наворотили-то. Иди сюда http://localhost/Tools/phpMyAdmin/, потом в привилегии, там выбираешь рута и "редактировать привилегии". Задаёшь пароль. Потом сюда:
\home\localhost\www\Tools\phpmyadmin
Файл config.inc.php. Править так:
$cfg['Servers'][$i]['password'] = 'тут пароль'; // MySQL password (only needed
// with 'config' auth_type)
И всё.