>>[Tue Nov 27 17:41:15 2007] [crit] (2)No such file or directory: mod_rewrite: could not init rewrite log lock in child

я так понимаю модуль сообщает о невозможности записи в лог файл. почему так происходит?

>>для ясности скажу что /usr/local/etc/apache22 есть симлинк на /chroot/apache/usr/local/etc/apache22

судя по ошибкам мне кажется ты сделал ровно наоборот тем не менее, делать символическую ссылку из недоступного, после chroot, каталога в новый нелепо. симлинк это всего лишь файл с именем файла на который он ссылается и атрибутом того, что он не есть непосредственный файл, а симлинк поэтому каталог так же будет недоступен: если уж и делать, то жесткую ссылку (man ln). только вроде на каталог ее сделать не удастся.. вообще тут достаточно проблем, связанных с ограничением апача, например мне будет интересно знать как ты будешь с таким апачем запускать скрипты и тд ну не считая тупой установки всего в /chroot зачем тебе апач так "запирать"?