Загрузка с с чего у тебя стоит?
может биос корневой раздел не видит? хз.
Настройка загрузчика LILO производится при помощи содержимого файла /etc/lilo.conf

В LIlo как раз и указывается какие операционки присутствуют на диске.
короче кидай свои настройки как и было сказано выше

ах да ты случаем usb диском не пользуешься ?