Я уже сталкивался с этой проблемой 2 года назад... Вот намучился Щас уже точно решение не помню, но это как ни странно связанно с MsAgent... Советую в первую очередь проверь автозагрузку, еще можешь посмтореть FileMon-ом и RegMon-ом что происходит в системе при вылете cmd.exe. так же можешь проверить систему с помощью AVZ