а как тебе bat'ник?
что-то вроде

del /Q c:\autorun.*
del /Q d:\autorun.*
del /Q %systemroot%\system32\autorun.*

и т.п.


ЗЫ.
кстати, программка против авторанов мне попадалась..
http://www.bombina.com/load/anti_autorun.exe
правда что она конкретно делает не разбиралась. возможно просто удаляет файлы по принципу моего батника.. ничего серьезного не попадается чтобы проверить