То что я знаю конкретного по логике работы джава-чатов описано здесь http://antichat.ru/javachat_pro.shtml .

Что касается сравнения характеристик различных чатов, то должен сказать, что скорость современных HTML-чатов, работающих в режиме stream по скорости мало отличается от джава-чатов.
Скорость работы конечно у джава немного быстрее, но зато имеется много недостатков: во-первых большое время загрузки апплета. Во-вторых - на машине может быть не установлен движок джавы. В-третьих - оформление джава чатов довольно примитивное, возможности HTML намного больше. А самое главное - microsoft больше не поддерживает джаву и поэтому она будет медленно умирать.
Поэтому, как мне кажется, следует все же больше уделять внимание IRC чатам, чем Java.