Как дополнительная проверка к капче, JS с обфускацией довольно неплохая идея. Но для этого AJAX не нужен (нормальному боту пофигу как запрашивать страницы, он с одинаковой эффективностью и AJAX симитирует, и обычный запрос).
Как самостоятельная проверка - очевидно что такой способ проигрывает капче в эффективности.
Как не прячь JS, он всеравно остается исполняемым кодом, который можно загнать в JS интерпретатор и обойти все обфускации и крипты (ибо браузер тоже должен как-то его обработать).
Где взять интерпретатор ? Mozilla Firefox - опенсорсовый проект, и там например есть постоянно обновляемый интерпретатор JS.