Практика должна начинаться с простых скриптов, а не с полнофункционального шелла.

Я такой вопрос вообще не понимаю. При достаточном уровне знаний в том же php его не возникает. Могу ответить только абстрактно - получаем список файлов из заданной директории (функции opendir(), readdir(), closedir()), и, выводя список диров и файлов в браузер, добавляем к имени всех файлов (filetype()) ссылку на скрипт, открывающий файл для редактирования (простейший пример: print "<a href='myshell.php?act=edit&file=".urlencode($file_ name)."'>edit</a>"; ).