это php приложение, проверка обновления предполагается не через cron а при заходе администратором в панель управления и начало закачки по его команде => гипотетически может получится, что клиент Х долгое время не посещающий панель управления будет вынужден обновляться с версии 1 на версию 3, так как провафлил обновление до 2 => тут надо как-то п умному придумать контроль версий, тем более что у разных клиентов список файлов может различаться (у кого-то установлены специальные уникальные плагины)