ааа те вывод нужен?...
по идее можно так, но я не пробовал

int **arr;

arr[0][0] = malloc( sizeof( int ) );
arr[0][1] = maloc( sizeof( int ) );

ну и вывод также
for (int i=0; i < num; i++)
for (int j=0; j < num; j++)
{
fprintf( stdout, arr[i][j] );
fflush( stdout );
}