У миранды шифрование, плагин SecureIM или Gnupg можа прикрутить.

Если нету плагина, внешняя прога, сделаная тож под винду для разных, клиентов можа использовать (название пож отпишу)

В никсах знаю в копете плагин шифрования по pgp , но с плагинами для миранды думаю не совместим.

Миранду в wine сег проверю//