А что именно не скрывает? WinExec("path+name", SW_HIDE) должен скрывать, если конешн прога сама себя не делает видимой, т.е. назначает себя SW_SHOW, тогда попробуй либо размер окна в 1,1 установить, и перетащить куда нибудь за пределы рабочего стола.