Установил параметр StreamProcessors в значение 112.

Для MD5:

• Hashes: 13. Average speed: 329.25M p/s.
• Hashes: 25000. Average speed: 282.28M p/s.
• Hashes: 50000. Average speed: 258.05M p/s.

Для MySQL:

• Hashes: 9. Average speed: 625.70M p/s.

Но есть проблема, я с самого начала не заметил, именно алгоритм MySQL в самом начале показывает такие цифры, как указаны выше (первые 3 секунды), а далее через каждую секунду снижается по 1-2 миллиона. В первом случае скорость снижалась до 550М (96 SP), во втором - до 585М (112SP). Снижение происходило в течение минуты, примерно. При переборе алгоритмом MD5 такого не наблюдается. Так и должно быть?