Разница есть. Присоединяюсь к товарищу. Читать хендбук и сборник статей на русском языке в freebsd куда удобней, чем выискивать на азиатских форумах советы по linux. В первый же день, как перелез с freebsd на gentoo я это почувствовал. Манулы есть, но они разбросаны, их нужно искать. Вообщем аналога хендбука я так и не нашел. Хендбук это как книга, с которой можно просто тупо сесть перед компьютером и разобраться в freebsd (из личного опыта у меня были только небольшие знания консоли)

Но по сабжу лучше что-нибудь попроще. Никаких slackware и gentoo - бесспорно.
Не знаю как в ubuntu, но вот в opensuse есть удобная установка софта и система обновлений, которая работает оперативно (вчера были новости про BIND, сегодня вышло обновление). Так-что лучше искать дистрибутив "поставил и забыл", чтобы не нужно было периодически заниматься вопросами безопасности (ставить патчи и тп), компилить ядра и прочее. Этим должен заниматься сам дистрибутив и его создатели.