1. Открываешь файл fopen()
2. Читаешь его fread()
3. Разбиваешь получившуюся строку на элементы массива каким-нибудь preg_split() или просто split()
4. Выводишь первый элемент массива echo(array['0'])
5. Закрываешь файл fclose()
6. Удаляешь первый элемент из массива array_shift()
7. Открываешь файл на запись стирая все предыдущее fopen с аттрибутом w+
8. Пишешь все в файл по элементам в цикле
9. Закрываешь файл.

Можно конечно оптимизировать.