Есть мнение, что при установке на один физический HDD связки WinNT (2k/XP/2003 - нужное подчеркнуть) плюс *nix, МелкоМягкая ось должна стоять исключительно в первом логическом разделе (то есть в "Logic-Primaty-Active")...
У меня возникала такая проблема при установке WinXPSP2 + Mandrake v9.0... При установке Винды вышеуказанным способом проблема решилась...