Тогда возможно нтфс не определяется просто потому, что не смонтирован. Надо в /etc/fstab дописать строчку типа:
Это если на разделе hda3 ntfs и монтировать его в каталог /mnt/ntfs.
А насчет винды, как раз, чтобы грузилась, нужно указать этот самый раздел, как в данном случае hda3 с нтфс'ом, и тогда будет все ок. Главное определить на каком разделе стоит винда.