Если пакет был установлен из архива, взятого на сайте разработчика, то конфигурационный файл SquirrelMail хранится в подкаталоге config пакета.
Поэтому если SquirrelMail установлен из репозитария ALM, то конфигурационный файл хранится в подкаталоге /etc/squirrelmail.
А в подкаталоге config находится только символическая ссылка на файл.
Скрипт называется config.pl, и находится он в подкаталоге config.