HKEY_CLASSES_ROOT
Здесь хранятся данные всех расширений файлов и для каждого расширения указана программа, его понимающая.

HKEY_CURRENT_USER
Все настройки текущего пользователя

HKEY_LOCAL_MACHINE
Все настройки компьютера (как аппаратного, так и программного обеспечения)

HKEY_USERS
Настройки всех пользователей

HKEY_CURRENT_CONFIG
Сюда занесены сведения о текущей конфигурации ПК