Как по мне я бы поставил фряху(FreeBSD), нравиться она мне, и с пакеджами все норм да и с безопасностью, ну или Debian, накройняк Slackware(все мои знакомые(да и не знакомые) вынь адми почему то ставят имено ее). Хотя можна найти че нибудь и попроще и попонятней.
Но а если взять дедик, то админы тебе все и настроют, и в случай чего будет с кого спросить(ну или не админы, но все равно спрашивать с них ). Вообше полазий по *nix сайтам, та тебе полутчше обьяснят, что выбрать, что быстрее работает в твоем случаи и т.п., имхо.