Прочти тред https://forum.antichat.ru/thread84544.html
Все зависит от того, под что ты будешь использовать фс. Я использую обе, на разных дистрах

Википедия:
Были у кого нить проблеммы связанные с повреждением?

ЗЫ: gibson если не секрет скажи где какую фс юзаешь ) прислушаюсь к мнению линуксоида =)

Вообще-то терки по этому поводу лучше читать на ЛОРе, столько раз перетирали что многое запомнилось
По стабильности ext3 вроде опережает ReiserFS в случаях моментального отключения питания. По крайне мере большую часть удастся восстановить, было у меня. С ReiserFS сам не эксперементировал, но по отзывам иногда рушится полностью.

Я использую и ту и ту.
/ ext3
/home ReiserFS
ну и swap

Отдельный boot следует создавать если ты знаешь что тебе это даст.
А даст это только то что если запоришь всю систему сможешь запустить только ядро и попытаться востановить.
boot обычно делают ext2 или ext3
Но например мне это не нужно, дома всегда какая нибудь болванка с liveCD валяется, так что если что то случится могу с ней загрузится.
Райзер лучше работает с мелкими файлами типа mp3, документы.

Разделение на несколько разделов полезно для того, чтобы не засорять все одномоментно. Кроме /boot также полезно выделять в отдельные разделы диск для временных файлов, для логов. Эта информация доступна в большинстве man, faq, howto.